2025年5月22日-25日，由廣東省精準醫(yī)學應用學會主辦，廣東省精準醫(yī)學應用學會臨床生物信息分會與中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院細胞分子診斷中心承辦的第七屆逸仙臨床生物信息培訓班在廣州舉辦。此次培訓以理論+實操為特色，致力于解決臨床實踐中的主要問題，成功吸引了來自全國各地的近200名臨床生信從業(yè)人員參與學習，有力促進了臨床生信員的技術能力與水平提升，為NGS技術臨床應用不斷提速。

廣東省精準醫(yī)學應用學會常務副會長兼秘書長孫炳剛，廣東省精準醫(yī)學應用學會臨床生物信息分會主任委員、中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心歐陽能太教授出席開幕式并致辭。培訓班匯聚了來自安徽、澳門、北京、廣東、福建、廣西、海南、浙江、湖南、湖北、江蘇、江西、遼寧、山東、上海、四川、新疆、云南、河南、貴州、重慶等多個省市地區(qū)的學員前來交流探討，現(xiàn)場座無虛席。開幕式由廣東省精準醫(yī)學應用學會臨床生物信息分會常務委員、中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心副主任張寅教授主持。

廣東省精準醫(yī)學應用學會常務副會長兼秘書長孫炳剛

廣東省精準醫(yī)學應用學會臨床生物信息分會主任委員、中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心歐陽能太教授

廣東省精準醫(yī)學應用學會臨床生物信息分會常務委員、中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心副主任張寅教授主持開幕式

開篇奠基：分子生物學與測序技術

中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心張寅老師圍繞《基因與基因組的基本概念》，系統(tǒng)講解了基因結(jié)構(gòu)、分子生物學概念及測序發(fā)展歷程，重點剖析人類基因組測序及版本迭代差異。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心蔣圓玲老師圍繞《DNA的合成、損傷與修復》，從特點、原則及過程詳解真核生物DNA復制機制與意義，并對DNA損傷誘因、后果及臨床檢測影響進行了深入分析。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心羅知奇老師聚焦《一代測序技術》，以Sanger測序和片段分析為核心，解析原理、實驗流程、結(jié)果判讀及臨床應用。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心黃靖華老師圍繞《二代測序技術》，以“邊合成邊測序”（SBS）原理介紹NGS技術，詳解擴增子法與雜交捕獲法的文庫構(gòu)建流程，并強調(diào)核酸、文庫及測序環(huán)節(jié)的質(zhì)控要點。這些課程為后續(xù)臨床生信學習奠定了理論基礎。

夯實基礎：臨床生信基礎

在NGS數(shù)據(jù)分析、變異注釋、變異可視化、數(shù)據(jù)質(zhì)控方面，中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心歐陽能太教授介紹了《NGS數(shù)據(jù)分析流程與原理》，涵蓋堿基識別、序列比對以及變異的識別、注釋、解讀和編寫報告等過程，指出前序自動化分析較完善，而變異解讀尤其個體化基因變異分類需臨床生信人員憑豐富經(jīng)驗精細分析，并著重強調(diào)NGS報告必須精準呈現(xiàn)基因變異臨床意義分類。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心夏丹老師在《HGVS基因變異命名法》課程中系統(tǒng)講解了該命名法的核心規(guī)則與應用場景，重點剖析臨床報告常見命名錯誤，并結(jié)合ACMG指南強調(diào)了標準化命名對變異分類與數(shù)據(jù)共享的重要性。通過典型案例生動演示了如何避免命名歧義，提升分子檢測報告的準確性與國際兼容性。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心蔣圓玲老師圍繞《變異注釋及實操練習》，介紹NGS數(shù)據(jù)分析中變異注釋的基本內(nèi)容，從基因組功能、數(shù)據(jù)庫信息和預測軟件結(jié)果注釋三方面闡述輸出文件，以實際下機文件為例介紹表格數(shù)據(jù)分類并進行人工變異篩查。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心廖健偉老師通過分享《IGV軟件介紹及實操練習》，強調(diào)IGV軟件使用對于臨床變異復核的重要意義，并對軟件的臨床應用方向、軟件功能展開了相關介紹，隨后通過三個例子的演示，引導學員進行實操，進一步加強了大家對軟件的掌握。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心黃永勝老師在《測序數(shù)據(jù)質(zhì)控案例實操示范》中，結(jié)合重要性、數(shù)據(jù)類型、常用指標等方面展開講解，為大家介紹了如何看懂和規(guī)范進行測序質(zhì)控，并以病例形式講述了問題及解決策略。

學員們進行實操練習

在胚系變異評級及實操方面，中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心蕭曉琴老師在《胚系變異分類ACMG指南》課程中，介紹了該指南的基本框架，詳細闡釋了指南的制定背景、核心分類原則及證據(jù)評級體系，深入解析了分類標準與判定邏輯。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心李曉娟老師在《貝葉斯原理及記分法》的分享中，闡述了貝葉斯定理在胚系變異評級證據(jù)拓展中的應用，在此基礎上，通過對不同級別證據(jù)賦實現(xiàn)變異定量分類，助力意義未明變異（VUS）的進一步分類和臨床指導。隨后在《ACMG胚系變異分類標準的更新》的有關分享中，指出證據(jù)使用處于動態(tài)調(diào)整過程中，隨著研究的深入和證據(jù)的積累，許多證據(jù)的使用都有了更細化的建議，更有助于對胚系變異進行分類。但證據(jù)的復雜性，需同行間、實驗室內(nèi)不斷討論明確應用場景。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心鄧舒韻老師通過《遺傳病常用數(shù)據(jù)庫實操示范》，介紹了OMIM、ClinVar和ClinGen數(shù)據(jù)庫，并帶領學員進行實操，強調(diào)三者是遺傳病生信解讀重要工具，各有側(cè)重又有重疊。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心夏丹老師在《常用人群數(shù)據(jù)庫、計算機預測軟件的實操示范》中講解了gnomAD人群數(shù)據(jù)庫應用，錯義、經(jīng)典/非經(jīng)典剪接變異致病性預測策略，并重點強調(diào)計算機預測結(jié)果需結(jié)合臨床表型謹慎解讀，規(guī)避假陽性/陰性風險。

在體細胞變異評級及實操方面，中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心歐陽能太教授通過分享《體細胞變異分類ClinGen指南及報告規(guī)范》，指出腫瘤NGS檢測的體細胞變異分類需遵循該指南，涵蓋致癌性和臨床意義分類，罕見變異需收集人群數(shù)據(jù)等證據(jù)累積記分進行致癌性分類，再依據(jù)靶向藥物批準情況等進行臨床意義分類。同時，他還強調(diào)NGS報告需規(guī)范變異分類且確保準確。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心付莎老師以“腫瘤常用數(shù)據(jù)庫實操示范”為切入，首先闡述了了常用數(shù)據(jù)庫的基本功能及應用價值，隨后介紹了gnomAD、Varcards、Cancer Hotspots、OncoKB、DICIPHER、AutoPVS1等數(shù)據(jù)庫，并結(jié)合實例操作加深了學員們的理解。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心廖健偉老師在《體細胞變異致癌性分類實操練習》中介紹了體細胞致癌性評級一般步驟，并結(jié)合非小細胞肺癌、腸癌以及子宮內(nèi)膜癌的病例，通過在線數(shù)據(jù)庫進行了帶教分析。

探索前沿：遺傳病臨床生信

中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心李曉娟老師分享了《遺傳病生信分析流程的搭建》，從人員專業(yè)背景、生信流程建立驗證、優(yōu)化更新及服務器管理等方面展開介紹，強調(diào)規(guī)范記錄以產(chǎn)出穩(wěn)定結(jié)果。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心蕭曉琴老師在《全外顯子組在遺傳病中的應用》中，介紹了全外的適用人群以及臨床應用，但也表示同時存在一定的挑戰(zhàn)，遺傳病的診斷有時候需要結(jié)合多種檢測方法才能明確診斷。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心彭小芳老師通過病例分享《遺傳病CNV生信分析》，闡述了判斷CNV真實性及致病性的分類要點，強調(diào)需查閱數(shù)據(jù)庫、了解檢測平臺特性。聚焦《罕見遺傳病生信分析案例分享》，中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心鄧舒韻老師分別從患者的表型、基因檢測結(jié)果和致病性評級三個角度分享了兩個肌營養(yǎng)不良的罕見遺傳病病例，強調(diào)對于VUS變異可以從多個方面增加評級證據(jù)以更好地理解VUS的潛在意義，為臨床提供可靠的分子診斷結(jié)果；中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心張潔明老師則通過兩個罕見遺傳病的生信分析案例，采用“邊學邊用，邊用邊學”模式，分享了自己對評級證據(jù)使用的心得體會。

聚焦熱點：腫瘤臨床生信

在腫瘤基因變異治療、診斷以及預后方面，中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心廖健偉老師分享了《腫瘤基因變異靶向治療與耐藥的生信解讀》，介紹了ESMO推薦的實體瘤靶向治療靶點，并通過一個經(jīng)典的腸癌案例，結(jié)合CLINGEN和AMP指南對NRAS和BRAF變異進行評級和變異分類。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心付莎老師透過醫(yī)生視角分享了《腫瘤基因變異診斷生信解讀》，以病例形式分享了不同類型的基因變異（特異性驅(qū)動基因、高頻基因），對臨床診斷方面的價值。特別是在疑難病例中，可為診療提供新的思路。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心黃永勝老師分享了《腫瘤基因變異預后生信解讀》，結(jié)合病例，從體細胞致癌性分類和臨床意義分類兩個角度，圍繞肺癌預后相關基因KRAS，彌漫大B細胞淋巴瘤相關基因TP53，以及子宮內(nèi)膜癌分子分型，講述了變異分類的重要性。

在腫瘤熱點檢測方面，中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心歐陽能太教授在分享的《MET ex14跳突的檢測與解讀》中強調(diào)：在基于DNA的NGS檢測中確定MET 14號外顯子跳躍突變是通過對影響剪接的變異的判讀實現(xiàn)的，生信人員需對影響剪接的各熱點變異熟記于心。同時，他還分享了《MSI的檢測原理與生信解讀》，指出很多腫瘤，特別是結(jié)直腸癌和子宮內(nèi)膜癌需要檢測MSI，以便預測預后和指導免疫治療。免疫組化、PCR-毛細管電泳和NGS均可檢測MSI，它們之間各有優(yōu)缺點，需要對MSI的概念、發(fā)生原理以及檢測原理具有深入的理解。在蔣圓玲老師分享的《BRCA1/2與HRD的檢測與解讀》中，介紹了BRCA1/2基因的檢測方法和臨床變異分類，以及HRD檢測的原理、方法和意義。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心廖健偉老師通過分享《ctDNA與MRD的檢測與生信解讀》，著重介紹了ctDNA NGS檢測的注意事項，并結(jié)合幾個典型病例，進一步傳遞了ctDNA和MRD的臨床解讀經(jīng)驗。

在臨床應用方面，中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心王厥老師在《子宮內(nèi)膜癌的分子分型》中，主要通過病例分享形式，介紹了分子分型中關鍵基因致癌性評級，并討論了同時存在多個分子分型相關變異時的分型策略與判斷依據(jù)。這一內(nèi)容對指導臨床個體化治療方案的制定具有重要意義。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心尹欣科老師以《甲狀腺癌的基因檢測與生信解讀》為題，結(jié)合病例介紹了基因檢測對甲狀腺腫瘤輔助診斷以及預后預測的價值，并通過實操和學員一起對DICER1基因罕見突變位點進行致癌性評級。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心歐陽能太教授在《結(jié)直腸癌的NGS檢測與生信解讀》中，介紹了各專業(yè)指南，并明確指出結(jié)直腸癌需要進行KRAS、BRAF、Her-2、POLE、MSI等檢測，以便精準指導用藥。他還強調(diào)：對于這些基因罕見位點變異的分類是這次培訓班最重要的任務，通過前面介紹的致癌性分析以及臨床意義分類，有可能甄別出更多的患者對精準治療收益。

中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心黃永勝老師圍繞《肺癌罕見變異分類實操示范》，以肺癌EGFR罕見突變?yōu)槔蓽\入深介紹了體細胞變異致癌性分類的流程，詳細講解了變異致癌性分類證據(jù)尋找的過程和結(jié)果解讀，并通過實例進行了相應的訓練。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心蔣圓玲老師在《乳腺癌罕見變異分類實操示范》中，介紹了兩個乳腺癌基因檢測病例的變異，并且用實操的方法與學員共同完成了變異分類。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心尹欣科老師通過分享《腫瘤NGS報告審核要點》，強調(diào)人工審核的要點主要包括數(shù)據(jù)質(zhì)控、變異的真假、變異致癌評級以及變異的臨床分類，并結(jié)合實操，帶領學員深刻體會了人工審核基因重排變異過程中需注意的要點。

拓展視野：病原體臨床生信

在病原體臨床生信分享中，中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心張寅老師首先分享的《病原NGS生信解讀重要原則》，主要介紹了病原NGS技術原理、生信解讀的流程、分析的關鍵點、以及耐藥基因、株系分型分析等內(nèi)容。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心汪單蘭老師分享的《病原NGS數(shù)據(jù)質(zhì)控要點》，著重展示了病原NGS數(shù)據(jù)下機后的生信分析質(zhì)控、人工審核質(zhì)控以及如何通過質(zhì)控減少假陰性假陽性等內(nèi)容，案例典型且系統(tǒng)。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心譚妮老師分享的《序列比對與blast應用實操示范》，主要介紹了BLAST的原理以及應用，通過案例實操介紹如何正確的選擇數(shù)據(jù)庫，在何種情況需要調(diào)整參數(shù)，如何辨別基因組污染以及如何判斷比對結(jié)果的可靠性等。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心林翹老師在《病原體mNGS生信分析案例分享》中，通過三個臨床病例，系統(tǒng)展現(xiàn)了病原NGS的生信解讀流程。課程內(nèi)容涵蓋下機數(shù)據(jù)質(zhì)控、性別分析、批次檢出等關鍵步驟，并深入探討了微生物假陽性及病原體在非常規(guī)部位檢出的復雜情形。中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院分子診斷中心方俊粵老師圍繞《病原體mNGS生信分析案例分享》，系統(tǒng)分享了mNGS技術流程、BLAST數(shù)據(jù)庫比對策略及生信分析挑戰(zhàn)，結(jié)合臨床案例，深入探討了低序列解讀、數(shù)據(jù)庫污染等關鍵問題，并著重強調(diào)多學科協(xié)作與臨床驗證的重要性，為提升感染性疾病精準診斷提供了新思路。

培訓班閉幕式上，歐陽能太教授對本次會議中各位講者的精彩分享給予高度評價，并對所有與會嘉賓的積極參與和踴躍討論表示感謝。他指出，此次培訓緊扣臨床需求，課程內(nèi)容不僅還涵蓋了分子生物學基礎、基因測序技術，還有生信基礎與實操練習、腫瘤生信分析解讀與實例練習、遺傳病生信解讀與實例練習，以及宏基因組生信分析解讀與實例練習，為各級醫(yī)院培養(yǎng)和輸送了一大批“既會分析數(shù)據(jù)，又懂臨床需求”的專業(yè)人才，有力推動了生物信息在臨床應用中的深入發(fā)展。