當地時間13日凌晨，伊朗首都德黑蘭傳出連續爆炸聲。隨后以色列國防部證實，以色列對伊朗發動打擊，并宣布以色列全國進入緊急狀態。

　　當日以色列關閉了其領空，并且暫停了所有往返以色列的航班。以色列航空公司宣布，從特拉維夫本-古里安國際機場撤離旗下飛機。預計本-古里安國際機場將在即將到來的周末繼續關閉，禁止航班起降。

　　同日，伊朗宣布關閉該國領空，直至另行通知。同時暫停德黑蘭伊瑪目霍梅尼國際機場航班起降。

　　隨后，有多地航空公司陸續表示已暫停往返以色列、伊朗地區的航班。

俄羅斯

　　俄羅斯最大的航空公司俄羅斯國際航空公司發布公告稱，鑒于伊朗領空關閉，為確保飛行安全，俄羅斯國際航空被迫調整部分航班計劃：莫斯科與德黑蘭之間的航班全部取消。莫斯科往返阿聯酋迪拜、阿布扎比、卡塔爾多哈（包機）及馬爾代夫首都馬累的航班航線將調整，改道經巴基斯坦領空繞行伊朗等。所有航線調整將持續至民用航空器飛行安全完全恢復為止。

迪拜

　　迪拜航空表示，已暫停飛往安曼、貝魯特、大馬士革、伊朗和以色列的航班。

荷蘭

　　荷蘭皇家航空公司宣布取消所有飛往特拉維夫的航班，至少持續到7月1日。

卡塔爾

　　卡塔爾航空公司宣布，鑒于當前緊張的地區局勢，卡塔爾航空暫停所有前往伊朗和伊拉克的航班，恢復時間待定。

塞浦路斯

　　13日，塞浦路斯機場方面負責人表示，大約25班次往返以色列和塞浦路斯拉納卡和帕福斯機場的航班被取消。與此同時，20班次從歐洲和美國前往中東地區的航班備降至拉納卡和帕福斯機場。機場方面已經啟動危機管理，妥善安置旅客。

　　此外，部分附近地區受到對該地區安全擔憂加劇的影響，于13日取消航班、關閉領空。

約旦

　　據約旦民航監管機構消息，約旦民用航空管理局宣布臨時關閉約旦領空，暫停所有進出和過境航班運行。旨在應對當前地區局勢升級可能帶來的安全風險。

黎巴嫩

　　多家航空公司于13日取消了飛往黎巴嫩首都貝魯特機場的航班。取消航班的航空公司包括迪拜航空（Fly dubai）、阿聯酋航空和埃及航空。

科威特

　　科威特民航總局當地時間13日中午宣布，鑒于該地區當前局勢，科威特國際機場部分航班將改道、取消或重新安排。目前正在與運營科威特國際機場進出港航班的航空公司進行協調。